Nat Biotechnol:研究不能重复?可能是HeLa细胞系“渐变”了

2021-10-25 23:22:04 来源:
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HeLa肝细胞已经在世界性的许多实验者室培育出了近70年,并且长期以来被并不认为是无限用水的不衰的不同肝细胞。然而,2同月18日发表在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新学术研究表明,肝细胞在多种不同实验者室彼此间发挥作用很大相似之处,这引发了对肝细胞系学术研究以此类推性的质疑。“我很感到高兴看不到这项学术研究,但在某种意义上我并不感到不快,”斯隆迪恩琳癌症之前心的底物进化学家Prasad Jallepalli说,他没有参与这项学术研究。这并不是HeLa肝细胞系自孕育以来第一次出现独有的报道:长久以来,其他学术研究小组也表明了HeLa肝细胞性状微彼此间在基因序列和RNA表述的显着相似之处。这项最近学术研究首次全面分析了各种HeLa性状微的特异性性状(多种不同SP的HeLa肝细胞系与世隔绝在世界性的各个实验者室),并且首次表明特异性值得注意避免了蛋白质表述和特异性的推移。HeLa肝细胞“衰了”?在这项学术研究之前,学术研究工作人员从6个国家的13个实验者室获取了14份HeLa试样,并在不同的实验者室先决条件下进行培育出。他们首先举例来说了基因拷贝数性状,推断出了它们基因组彼此间的显着相似之处。结果发现,HeLa性状微彼此间,同样是CCL2和Kyoto性状微彼此间发挥作用着巨大的值得注意。再进一步的分析表明,许多这些特异性相似之处再生为mRNA产生的推移,并且在很小程度上再生为蛋白质轻元素的推移。学术研究工作人员份文件说,HeLa CCL2和Kyoto肝细胞系的mRNA组和蛋白质组谱彼此彼此间的相似之处,就像来自两种多种不同型式的组织的癌肝细胞系彼此间的相似之处一样。HeLa性状微在培育出现实生活之前湿润飞行速度也多种不同,一些肝细胞群人能够17.5全程才能翻倍,而另一些肝细胞在不同的培育出先决条件下能够话费超过32全程。它们对沙门氏菌接种的反应也有所多种不同:与其他两种衰微相对于,一种衰微对接种的敏感性很低,学术研究工作人员将其归结低水平的蛋白质复合物,这种蛋白质复合物在细菌踏入宿主肝细胞之前起作用。在一项实际上的实验者之前,学术研究小组通过培育出肝细胞系三个同月,来推论HeLa性状微的基因表述是否就会随着短时间发生推移。学术研究工作人员记录了早期肝细胞和晚期肝细胞彼此间基因表述相似之处大约6%。苏黎世联邦理工学院底物系统生物学学术研究员的Ruedi Aebersell教授是该学术研究的合着者,他说,“即使在同一个实验者室那时候,这些肝细胞的相似之处和推移飞行速度也是更加惊人的。”他至少,如果一个学术研究生在项目开始时用HeLa肝细胞系做了一个实验者,并在六个同月后被要求以此类推这个实验者,他们似乎就会得到多种不同的结果。关于学术研究之前的“可粘贴性危机”的讨论大多数集之前在实验者设计、建模方面的缺陷,以及作为主要驱动主因的受污染或白纸错表单的肝细胞系。但是Aebersell并不认为,HeLa肝细胞系和癌肝细胞系的生物学相似之处似乎是极为重要。为什么就会“衰”?麻省理工学院的肝细胞进化学家Tim Stearns并不认为有几个似乎的原因可以阐释为什么肝细胞系在长短时间培育出下就会发生推移。首先,HeLa肝细胞是已知基因组不稳定的癌肝细胞,因此很似乎随短时间随机突衰。此外,它们还就会在实验者室之前受到各种湿润先决条件的影响,这似乎就会日后肝细胞进化出独有的特征。例如,他说,哺乳动物肝细胞的培育出包含将其培育出到充满一个培育出皿为止,从培育出皿之前抽取一部分肝细胞,然后将它们放在另一个培育出皿之前湿润,这一现实生活称为内部矛盾。“每个人做这件事的方式则都有点多种不同,”他说道。最近这些发现,对于进化培育出肝细胞的学术研究结果的阐释和带入性有一定的意义。Aebersell和他的同事在论文之前设想了几个具微的解决办法。首先,学术研究工作人员应使用癌肝细胞系的早期传代,并确保在同一肝细胞系的多种不同试样之前以此类推同一肝细胞系的实验者。更不可忽视的是,进化学家应相符地份文件他们在取值的学术研究之前使用的肝细胞系性状微。
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