Nat Biotechnol：研究无法重复？可能是HeLa细胞系“变”了

HeLa细胞内已经在欧美的许多数据分析团队培植了据统计70年，并且长期以来被看来是无限供应的不坏的并不相同细胞内。然而，2同月18日发表在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新数据分析声称，细胞内在各不并不相同数据分析团队密切关；也存在很大关联，这引发了对细胞内；也数据分析一般而言的质疑。“我很高兴看到这项数据分析，但在某种涵义上我并不感到惊讶，”亨特凯特珊癌症中都心的分子可生物学家Prasad Jallepalli说，他没参与这项数据分析。这并不是HeLa细胞内；也自面世以来第一次显现出多种不同的报道：多年来，其他数据分析的小组也证明了HeLa细胞内反转躯密切关；也在基因序列和RNA暗示的除此以外关联。这项同并不一定数据分析首次全面分析了各种HeLa反转躯的遗传基因基因（各不并不相同批次的HeLa细胞内；也生活在欧美的各个数据分析团队），并且首次证明遗传基因异质性引致了蛋白暗示和性状的不够大坏化。HeLa细胞内“坏了”？在这项数据分析中都，数据分析部门从6个国家政府的13个数据分析团队得来了14份HeLa结果显示，并在并不相同的数据分析团队先决条件下进行时培植。他们首先二阶了基因拷贝数反转，揭示了它们基因组密切关；也的除此以外关联。结果发现，HeLa反转躯密切关；也，特别是CCL2和Kyoto反转躯密切关；也存在着不够大的异质性。进一步的分析声称，许多这些遗传基因关联转化为mRNA产生的不够大坏化，并且在较小程度上转化为蛋白丰度的不够大坏化。数据分析部门简报说，HeLa CCL2和Kyoto细胞内；也的特异性组和蛋白组谱彼此密切关；也的关联，就像来自两种各不并不相同并不一定该组织的抗躯；也密切关；也的关联一样。HeLa反转躯在培植不够进一步中都潮湿飞行速度也各不并不相同，一些细胞内群需要17.5同一间隔时间才能翻倍，而另一些细胞内在并不相同的培植先决条件下需要话费超过32同一间隔时间。它们对乙型肝炎传染的催化也有所各不并不相同：与其他两种坏躯相比，一种坏躯对传染的持久性较低，数据分析部门将其归因于低水平的蛋白亚基，这种蛋白亚基在细菌进到宿主细胞内中都起作用。在一项实际上的实验室中都，数据分析的小组通过培植细胞内；也三个同月，来观察HeLa反转躯的基因暗示是否才会随着间隔时间发生不够大坏化。数据分析部门记录下来了晚期细胞内和晚期细胞内密切关；也基因暗示关联大约6%。卢塞恩联邦理工学院分子可；也统生物学数据分析所的Ruedi Aebersell大学教授是该数据分析的合着者，他说，“即使在同一个数据分析团队中都，这些细胞内的关联和不够大坏化飞行速度也是极其惊人的。”他估计，如果一个数据分析生在项目开始时用HeLa细胞内；也要用了一个实验室，并在六个同月后被拒绝移位这个实验室，他们确实才会得到各不并不相同的结果。关于数据分析中都的“可复制性危机”的讨论大多数密集都在自适应、数据分析方面的局限性，以及作为主要驱动主因的受污染物或贴错附加的细胞内；也。但是Aebersell看来，HeLa细胞内；也和抗躯；也的生物学关联确实是关键。为什么才会“坏”？柏克莱加州大学的细胞内生物学家Tim Stearns看来有几个确实的确实可以解释为什么细胞内；也在长间隔时间培植下才会发生不够大坏化。首先，HeLa细胞内是已知基因组不稳定的抗躯，因此很确实随间隔时间随机突坏。此外，它们还才会在数据分析团队中都受到各种潮湿先决条件的阻碍，这确实才会促使细胞内有机躯出独特的特点。例如，他说，哺乳动物细胞内的培植仅限于将其培植到充满一个容器为止，从容器中都抽取一部分细胞内，然后将它们放在另一个容器中都潮湿，这一不够进一步被称作内部矛盾。“每个人要用这件却说的方式都有点各不并不相同，”他说。同并不一定这些发现，对于人类培植细胞内的数据分析结果的解释和抹去性有一定的涵义。Aebersell和他的同僚在学术论文中都提出了几个具躯的解决方案。首先，数据分析部门不该用作抗躯；也的晚期传代，并确保在同一细胞内；也的各不并不相同结果显示中都移位同一细胞内；也的实验室。不够极为重要的是，生物学家不该清楚地简报他们在也就是说的数据分析中都用作的细胞内；也反转躯。